Vertraglicher Rahmen für die kulturellen Beziehungen ist das Abkommen über kulturelle Zusammenarbeit vom 23.06.1993. Der Schwerpunkt der Zusammenarbeit liegt im Sprach- und Schulsektor.

Der Deutschunterricht wird an 14 Schulen gefördert. Insgesamt lernen etwa 6000 Schüler in Paraguay Deutsch. Eine herausgehobene Stellung nehmen das Colegio Goethe (mit mehr als 1.200 Schülern) und das Colegio Alemán Concordia in Asunción ein. Auch die Schulen in den Hauptsiedlungsgebieten deutscher Einwanderer und Mennoniten im Landesinneren spielen eine wichtige Rolle.

Im Hochschulbereich entwickelt sich die bilaterale Zusammenarbeit insbesondere im naturwissenschaftlich-technischen Bereich, so durch den Besuch deutscher Wissenschaftler oder Studien- und Forschungsaufenthalte von Paraguayern in Deutschland, oft mit Unterstützung des DAAD. Derzeit gibt mehrere formelle Hochschulpartnerschaften. 2014 wurde die Deutsch-Paraguayische Universität UPA (Universidad Paraguayo-Alemana) gegründet, die binationale Hochschulabschlüsse insbesondere im Wirtschaftsbereich anbietet.

Das Deutsch-Paraguayische Kulturinstitut in Asunción hat sich zu einer geachteten Institution entwickelt, deren Veranstaltungen einen anerkannten Beitrag zum Kulturleben Paraguays leisten. Das Kulturinstitut arbeitet als Goethe-Zentrum eng mit den Goethe-Instituten der Region zusammen. Ein weiteres Deutsch-Paraguayisches Kulturzentrum befindet sich im Süden des Landes in Encarnación.

Die in den letzten Jahren durchgeführten Projekte zum Kulturerhalt (u.a. Restaurierung des Glockenturms der Jesuitenreduktion in Trinidad, Restaurierung und Digitalisierung des Bestands des Museo del Barro, Dokumenation des Kulturerbes der Aché-Indigenen) werden besonders geschätzt und gewürdigt. Die Botschaft fördert regelmäßig im Rahmen ihrer Möglichkeiten verschiedene kulturelle Veranstaltungen und Projekte wie Filmfestivals, Konzerte und Ausstellungen. Ein Eigenprojekt der Botschaft ist der seit 2014 durchgeführte Kunstpreis.